日韩人妻无码精品无码中文字幕,国产A级毛片久久久久久精品,18黑白丝水手服自慰喷水网站,亚洲熟女AV综合一区二区三区

您好!歡迎訪問保定米奇生物科技有限公司網(wǎng)站!
全國服務(wù)咨詢熱線:

19801430409

當(dāng)前位置:首頁 > 技術(shù)文章 > DAP-seq助力揭示YABBY11轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控楊樹葉形自然變異的分子機(jī)制

DAP-seq助力揭示YABBY11轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控楊樹葉形自然變異的分子機(jī)制

更新時間:2023-11-03      點擊次數(shù):735

20233月,北京林業(yè)大學(xué)生物學(xué)院宋躍朋教授課題組的研究成果發(fā)表在了Plant Physiology期刊上(影響因子7.4),文章題目為 “Enhanced genome-wide association reveals the role of YABBY11-NGATHA-LIKE1 in leaf serration development of Populus"的研究論文。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術(shù)鑒定了楊屬YABBY11轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合基序和靶基因。發(fā)現(xiàn)YABBY11與楊樹葉形自然變異顯著關(guān)聯(lián),為探索理想葉形遺傳改良奠定了理論基礎(chǔ)。

該研究發(fā)現(xiàn),在毛白楊基因組中,YABBY11由于存在提前終止位點(PtoYAB11PSC),從而導(dǎo)致鋅指結(jié)構(gòu)域缺失,進(jìn)而失去了對下游靶基因PtoNGAL-1PtoRBCL的轉(zhuǎn)錄激活作用,使葉緣鋸齒加劇、葉面積增大、光合利用效率提升。

image.png

 1 楊樹自然群體葉形變異顯著

楊樹葉片形態(tài)變異豐富,在種間與種內(nèi)都存在顯著的自然變異。為了闡明楊樹葉片形態(tài)自然變異的遺傳學(xué)基礎(chǔ),以毛白楊與小葉楊種質(zhì)資源群體為材料,發(fā)現(xiàn)在兩個關(guān)聯(lián)群體中,基因型-表型關(guān)聯(lián)顯著性最高的SNPs均位于YABBY11基因上。在毛白楊群體中,YABBY11具有提前終止位點(PtoYABBY11PSC),導(dǎo)致與DNA結(jié)合的鋅指結(jié)構(gòu)域全部丟失,僅保留了核定位信號。以YABBY11為候選基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,顯示提前終止位點僅存在白楊派中,暗示了YABBY11PSC可能是一個白楊派特異的基因變體。

image.png

 2 基于持續(xù)同調(diào)拓?fù)鋽?shù)據(jù)高通量量化的全基因組關(guān)聯(lián)分析

image.png

楊屬YABBY11基因系統(tǒng)發(fā)育樹

為闡明PtoYABBY11PSC攜帶的提前翻譯終止位點是否改變了YABBY11下游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),研究者利用表達(dá)數(shù)量性狀位點定位策略(eQTNs)分別對毛白楊和小葉楊群體YABBY11核酸變異與表達(dá)量進(jìn)行分析。在毛白楊群體中,97SNPs55個基因表達(dá)量顯著關(guān)聯(lián)。在小葉楊群體中,共發(fā)現(xiàn)61SNPs52個基因形成表達(dá)量顯著關(guān)聯(lián)。靶基因功能注釋結(jié)果顯示,PtoYABBY11PSCPsiYABBY11下游轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)基因顯著不同,暗示PtoYABBY11PSC攜帶的提前翻譯終止位點已經(jīng)顯著改變了毛白楊YABBY11下游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

image.png

 4 PsiYABBY11基因通過順式作用元件與下游靶基因相互作用

使用DAP-seq技術(shù),對具有完整轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)的PsiYABBY11下游靶基因進(jìn)行篩選,在164個基因上共篩選到220PsiYABBY11互作位點,其中37.5%的互作位點位于轉(zhuǎn)錄起始位點上游2000 bp范圍內(nèi)。對PsiYABBY11下游靶基因進(jìn)行KEGG通路注釋,PsiYABBY11下游靶基因主要富集在photosynthesis, oxidative phosphorylation, starch and sucrose metabolism, 以及 ribosome等通路中。聯(lián)合eQTNsDAP-seq分析結(jié)果,共篩選出NGAL1RBCLPHOTOSYSTEM II REACTION CENTER PROTEIN B (PSBB), ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA (ATPA)以及ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN (ATPE基因為PsiYABBY11的下游靶基因。酵母單雜交與EMSA實驗進(jìn)一步驗證了PsiYABBY11可以和NGAL1 RBCL基因的啟動子直接結(jié)合。雙熒光素酶實驗結(jié)果表明PsiYABBY11能夠激活NGAL1 RBCL基因表達(dá)。酵母單雜實驗結(jié)果進(jìn)一步證明了NGAL1與其下游生長素響應(yīng)靶基因CUC2也存在相互作用。該結(jié)果表明,YABBY11-NGAL1-CUC2 可能通過調(diào)控楊樹葉邊緣發(fā)育進(jìn)而導(dǎo)致葉片形態(tài)的自然變異。

image.png

 5 PsiYABBY11PtoYABBY11PSC分子功能解析

PtoYABBY11PSCPsiYABBY11的過表達(dá)株系中, PtoYABBY11PSC-OE植株葉長、葉寬、葉面積顯著增加,光合作用效率顯著提升,葉片邊緣鋸齒顯著加劇。PtoYABBY11PSC-OE植株葉長、葉寬、葉面積顯著減小,光合作用效率降低,葉片邊緣光滑,但是葉脈厚度與氣孔密度顯著增加。 PtoYAB11PSC-KO的基因敲除突變植株葉片邊緣光滑,但是光合作用效率與葉片面積沒有顯著改變。

image.png

 6 楊屬YABBY11調(diào)控葉形自然變異的分子機(jī)制

以上研究結(jié)果表明, YABBY11激活NGAL1表達(dá),進(jìn)而抑制CUC2基因表達(dá),調(diào)控光滑葉緣的形態(tài)發(fā)育。同時,YABBY11 激活RBCL基因表達(dá),導(dǎo)致Rubisco亞基裝配失調(diào),進(jìn)而光合作用效率下降。而在白楊派樹種中,YABBY11PSC由于攜帶翻譯提前終止位點,喪失了對NGAL1-CUC2模塊以及RBCL基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用,進(jìn)而導(dǎo)致葉片面積增大、葉片鋸齒加劇、光合作用效率提升。此外,YABBY11在毛白楊與小葉楊中均對脅迫信號響應(yīng)敏感,暗示了YABBY11-NGAL1-CUC2可能是基因組與環(huán)境信號互作調(diào)控葉形變異的關(guān)鍵分子調(diào)控模塊。該模塊為系統(tǒng)了解葉形響應(yīng)外界環(huán)境信號產(chǎn)生自然變異提供了一個全新的視角,為探索理想葉形遺傳改良奠定了理論基礎(chǔ)。




保定米奇生物科技有限公司
地址:保定市惠陽街369號保定中關(guān)村創(chuàng)新基地研發(fā)中心15層1508室
郵箱:info@michlab.cn
傳真:
關(guān)注我們
歡迎您關(guān)注我們的微信公眾號了解更多信息:
歡迎您關(guān)注我們的微信公眾號
了解更多信息
黑人大战日本娇小xxoo| 大屁股熟女一区二区三区| 京东一热本色道久久爱| 精品国产一区二区三区AV片| 羞羞答答麻豆国产免费观看| 亚洲熟妇AV一区二区三区| 亚洲色大成www亚洲女子| 国产真实乱人偷精品人妻| av无码一区二区三区| 1000部精品久久久久久久久| 老旺的大肉蟒进进出出| 欧美精产国品一二三区别| 女女女女BBBBBB毛片在线| 中国白嫩丰满人妻videos| 中文字幕乱码中文字乱码| 欧洲熟妇色XXXX欧美老妇多毛| 久久精品无码一区二区三区免费| 爆乳美女午夜福利视频| 久久久婷婷综合五月色麻豆| 久久人做人爽一区二区三区| 亚洲AV综合永久无码精品天堂| 人妻凌参观1看动漫在线| 人性情感短片视频高清 | 国产女人18毛片水真多18精品 | 公交车上荫蒂添的好舒服视频| 国产熟女一区二区三区四区五区| 调教 sm 重口 h文 hy| 天天躁夜夜躁狠狠躁av乐播蜜桃| 无遮掩爆乳全彩h漫画羞羞| 欧美又大粗又爽又黄大片视频| 欧美疯狂做受XXXX高潮| 久久超乳爆乳中文字幕| 精品人妻无码一区二区三区淑枝| 亚洲欧美强伦一区二区| 免费三级网站| 欧美精品偷自拍另类在线观看| 色综合AV综合无码综合网站| 午夜成人鲁丝片午夜精品| 亚洲精品无码成人| 学长别揉了我快尿了男男| 小悔的性荡生活|